根据1991年由澳洲联邦政府所修订的《澳洲国立大学法案》，ANU采用委员会制的方式治理校园。校务委员会由十五名委员组成，负责任命校长和院长、审核治校方针和年度预算、树立营运政策和程序，以及监督办学成果、产学合作和风险控管等。校务委员会的主席由ANU校监（Chancellor）担任；副主席由副校监（Pro-Chancellor）担任。校长（Vice-Chancellor & President）则是学校的行政首长，在校务委员会的授权与监督下，负责学校的实际营运和行政团队管理。
校监
澳洲国立大学历任校监（Chancellor）皆由德高望重的政要名流或学者出任。过去也曾由诺贝尔奖得主和卸任澳洲总理担任。除了主持校务委员会外，校监亦在毕业典礼上负责主持学位颁授仪式。
现任校监为Gareth Evans（2010-），曾任澳洲工党党魁；澳洲联邦参议院议长、司法部部长、外交部部长等；联合国秘书长顾问；国际危机组织执行长；亚洲太平洋经济合作会议（APEC）发起人与届APEC部长级会议主席；东南亚国协（ASEAN）区域论坛发起人；御用大律师；曾获澳洲联邦政府勋章和联合国奖章等；英国牛津大学荣誉院士、剑桥大学期刊编辑顾问、美国耶鲁大学与史丹佛大学顾问等等。
校务基金
在2011年，ANU获得约1.2371亿澳币的募款资金，超越墨尔本大学和雪梨大学成为人均获款的大学。
悉尼大学
墨尔本大学
新南威尔士大学
昆士兰大学
蒙纳士大学
西澳大学
阿德莱德大学
邦德大学
悉尼科技大学